Identity der Zink-Finger-Nukleasen mit Spezifität für Herpes-simplex-Virus Typ II genomischen DNA: Roman HSV-2-Impfstoff / Therapie Vorläufer Theoretische Biologie und Medizin Modellierung 2011, 08.23 doi: 10.1186/1742-4682-8-23
Veröffentlicht: 24. Juni 2011
Abstract (vorläufig)
Hintergrund
Herpes simplex Typ II (HSV-2) ist ein Mitglied der Familie Herpesviridae. Die Infektion des Menschen mit dieser doppelsträngigen linearen DNA-Virus verursacht genitale Colitis Krankheit und die bestehenden Behandlungsmöglichkeiten dienen nur dazu, die Symptomatik (Geschwüre) mit aktiver HSV-2-Infektion assoziiert, aber nicht beseitigen latenten Virus zu lösen. Als Ergebnis folgt eine Infektion mit HSV-2 ein Leben lang rezidivierende (aktiv versus latent) natürlich. Auf der Grundlage eines primitiven Bakterium anti-Phagen-DNA Verteidigung, die Beschränkung Modifikation (RM)-System, wir zuvor identifizierten die Escherichia coli Restriktionsenzym (Rease) EcoRII als neuartige Peptid Verbrauchsteuer oder irreversibel latente HSV-2-DNA aus infizierten Zellen zu zerstören . Allerdings Sequenzen der Ortsspezifizität Palindrom EcoRII 5'-CCWGG-3 '(W = A oder T) sind ebenfalls innerhalb des menschlichen Genoms und sind eine potenzielle Quelle von Host-Genom Toxizität. Dieses Feature hat vorherigen HSV-2 EcoRII basierte therapeutische Modelle Mikrobizide nur begrenzt, und unterstreicht die Notwendigkeit, künstliche REases (Zink-Finger-Nukleasen-ZFNs) mit einer Spezifität Ingenieur HSV-2 Genom-DNA nur. Hierin das therapeutische Potenzial von Zink Finger-Arrays (ZFAs) und ZFNs identifiziert und modelliert, mit einzigartiger Spezifität der HSV-2-Genoms. Methoden und Ergebnisse: Die Verwendung des gesamten Genoms von HSV-2-Stamm HG52 (. Dolan A et al,), und mit dem ZFN-Konsortiums CODA-ZiFiT Software standardmäßig voreingestellt, mehr als 28.000 ZFAs mit Spezifität gegen HSV-2 DNA identifiziert wurden. Mit Computational Montage (durch in-silico Anbindung an die Flavobacterium okeanokoites Endonuklease Fok I vom Typ IIS Klasse), 684 ZFNs mit Spezifität für die HSV-2 Genom, errichtet wurden. Graphic-Analyse der HSV-2 Genom-Spaltung Muster mit den zuvor identifizierten ZFNs ergab, dass die höchste Spaltung-Inzidenz in der 30.950 Basenpaare aufgetreten (~ zwischen den genomischen Kontext koordiniert 0,80 und 1,00) am 3 'Ende des HSV-2-Genoms. Bei ca. 3.095 bp vor und nach dem 5 'und 3' Enden der HSV-2-Genoms (genomische Kontext koordiniert 0,02 und 0,98, jeweils) waren Spezifität Stätten ZFNs für die komplette Exzision von über 60% der HSV-2 genomische Material geeignet aus infizierten menschlichen Zellen, durch den Prozess der nicht-homologen Ende (NHEJ). Darüber hinaus ein Modell über ein rekombinantes (ICP10-PK-Mutante) replikationskompetenten HSV-2 viraler Vektor für die Bereitstellung und Transduktion einer diploiden Kopie (oder Paar) der HSV-2-Genom-spezifischen ZFN Genotyp in Nervengewebe, wird vorgestellt.
Abschluss
ZFNs mit Spezifität gegen HSV-2 genomische DNA, die Vorläufer der neuen Host-Genoms HSV-2-Gen-Therapeutika und Impfstoffen wurden identifiziert werden.
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für Kontext zu sehen: (2008) Thema: Theoretische Heilung Spekulationen
... Also kurz gesagt, könnte ein ZFN-basierte Therapie gezielt auf eine bestimmte episomalen Standort auf der HSV-Genom, spalten beide Stränge der DNA, und entweder Einführung einer verderblichen Folge, dass die virale DNA inaktiv oder anderweitig nicht-pathogenen macht (z. B. nicht in der Lage zu replizieren) oder einfach nur spalten die DNA und im Laufe der Zeit auf Fehler in der HR Maschinen angewiesen, um Mutationen, die die Funktion von Genen zu stören einzuführen. In einem Szenario, das episomalen DNA erbracht vollständig funktionsfähig. In einem anderen der Episom kann nicht behaupten, Latenz in der Zelle und wird abgebaut und entfernt.
Wer noch keine Gedanken? Theoretisch kann dies funktionieren. Es gibt Probleme mit der Bereitstellung, Offsite-Spaltung Fragen, die zu unerwünschten geno-und zytotoxische Effekte und eine Reihe von komplizierten Design-Fragen. Ich denke, es sind immer die Angst Fragen der Änderung der Phänotyp von Neuronen zu. Aber ich sehe nicht, warum es nicht überall verfolgt wird.
Auch dies wäre eine vollständige Heilung der Krankheit sein. Keine Ausbrüche, keine viralen Partikel, keine Möglichkeit, eine Infektion des Menschen, die Sie lieben.
Ich bin zu schreiben, um einige Herpes-Forscher, um ihre Gedanken zu denken, aber würde keine Kommentare zu schätzen, vor allem von Menschen mit Mikrobiologie, Immunologie, Virologie, etc. Hintergründe
